Keine Rechte auf den meisten Systemordner

Hallo, seit eineige Zeit habe ich Probleme mit Vista. Auf einmal hatte ich kein Zugrif mehr auf die meisten Ordner im Vista Verzeichnis. Nachdem ich irgendeine Programm instaliere, nach ein en Neustart schaltet sich chkdsk ind löscht diese (ich vermute Vista lässt keine änderungseinträge im Registry) Benutzerkontensteuerung ist ausgeschaltet und ich bin Administrator. Die ordner die ich brauche muss ich jedesmal freigeben :-\