Eine Antwort hast du ja shon. Ich gebe dir jetzt noch eine kleine, stark vereinfachte Antwort, was den technischen Aufbau betrifft.
Zuerst einmal steht am Anfang jeder Partition der Bootsektor.
Anschließend folgt bei einer FAT-Partition eben die - FAT (File Allocation Table)
Mit anshließender Sicherheitskopie, falls mal eine defekt geht. Die FAT ist nichts anderes als ein großes Inhaltsverzeichnis: Datei x beginnt auf der Festplatte bei Cluster y. Wenn die Datei mehr als einen Cluster belegt, dann ist auch der nachfolgende Cluster vermerkt.
Der zentrale Punkt eines NTFS-Dateisystems ist die sogenannte MFT (Master File Table). Je nach Festplattengröße kann die auch schon mal ein paar GB groß sein. Im Gegensatz zum FAT-Dateisystem werden hier nicht nur Verweise auf Daten gespeichert, sondern auch Daten selbst. Kleine Dateien sind dadurch sehr schnell im Zugriff, weil nicht erst der Speicherort der Datei ausgelesen werden muss, um dann auf die Datei zuzugreifen, sondern die Datei direkt gelesen werden kann. Bei großen Dateien enthält die MFT dann allerdings auch wieder einen Verweis auf den Speicherort in der Partition.
So - dann sollte doch alles klar sein.... Ansonsten könnte ganz sicher auch mal goooglen helfen. Da wird man ja geradezu mit Ergebnissen erschlagen