Wenn bereits W2K drauf ist, kanns du das mir Win98SE vergessen; da musst du schon zu drastischeren Mitteln greifen.
Boote einfach das System mit CDROM-Unterstützung mit der Windows 98 CD.
Wechsel mit CD\WIN98 ins Installationsverzeichnis der CD und gebe dann FDISK ein.
Über FDISK löschz du alle Partitionen; sollte W2K auf einer NTFS Partition gewesen sein, so musst du über Punkt 3 (Partition löschen...) und dann Punkt 4 (Nicht-DOS Partition löschen) die NTFS Partitionen löschen.
Am Ende erzeugst du eine deinen Wünschen entsprechende neue primäre Partition und bootest anschließend neu.
Dann wieder von CD booten und anschließend FORMAT C: eintippen. Nach dem Format kannst du das Setup von Windows 98 über CD\WIN98 und dann SETUP ausführen.
Gruß,
Heiko
PS: FDISK ist eigentlich recht verständlich... immer erst die logischen und nicht-DOS-Partitionen löschen, dann das erweiterte Laufwerk und zuletzt die primäre Partition... dann eine neue primäre...