Falls Du NTBackup meinst, solltest Du IMHO alles so lassen wie es ist. Bei der Wiederherstellung, hast Du die Möglichkeit zu wählen, was und wie Du die Daten zurücksichern möchtest. Weiß aber nicht ob Du das komplette System mit NTBackup zurücksichern kannst, habe ich noch nie versucht, sollte aber funktionieren, schau mal in der Hilfe nach (Systemstatusdaten). Das einige Daten versteckt sind, spielt bei einer kompletten Wiederherstellung IMHO keine Rolle. Deine Anwendungsdaten funktionieren sowieso nur, bei einer kompletten Rücksicherung wieder richtig (Registry).