Na, ob die radikale Lösung, alles plattzumachen, wirklich so angemessen ist, bezweifle ich mal...
Nur um das mal klarzustellen, wenn Du genau dieselbe Prozedur, die Du bei der ersten Installation durchgespielt hast, wiederholst, dann wird der Fehler sich gnadenlos auch wiederholen!
Hier nochmal der Link, bitte ganz genau lesen:
http://portal.suse.com/sdb/de/2004/05/fhassel_windows_not_booting91.html
Da steht im Absatz Ursache ganz genau beschrieben, warum und wann der Fehler auftritt. Wenn diese Bedingungen wieder erfüllt sind, dann tritt der Fehler wieder auf.
Bist Du sicher, dass Du die Reparaturanleitung korrekt und vor allem 1:1 komplett durchgespielt hast? Druck die Seite doch mal aus und führe alle Schritte nochmal durch. Ich meine das, was unter dem Absatz Lösung im Unterabsatz Diskette beschrieben ist.
Und wenn Du kein Diskettenlaufwerk hast, dann opfere einen Rohling. Ich kenne keinen einzigen Fall, in dem die Raparatur nicht geklappt hätte, wenn die Anleitung 1:1 durchgespielt wurde. So kannst Du Dir das Plattmachen sparen und beide Systeme retten.
Wenn Du doch lieber alles plattmachen willst, wovon ich ausdrücklich abrate, dann beachte die Hinweise im Unterabsatz Wenn Linux noch nicht installiert ist, damit Du nicht unnötig Zeit verschwendest, weil der Fehler sonst einfach wiederholt wird.
Ach übrigens, FIXMBR und FIXBOOT bringen hier absolut gar nix. Beschädigt ist ja nicht der Bootloader, sondern die Partitionstabelle. Mit dem Bootloader stimmt ja alles, der ist nicht das Problem.
FIXMBR und FIXBOOT reparieren die Partitionstabelle nicht, haben aber den Nebeneffekt, dass sie, ohne einen Nutzen zu bringen, auch noch den Bootloader zerstören, so dass man an gar keines der beiden Systeme mehr rankommt. Dadurch wird die Situation also nur noch schlimmer.
Um nach einem FIXMBR oder FIXBOOT zumindest an das Linux-System wieder heranzukommen, bitte von der ersten Installations-CD booten und Installation wählen. Nein, dies ist kein Tippfehler, nicht das Rettungssystem, sondern wirklich Installation auswählen und die Frage nach der Sprache und die weiteren Fragen ganz normal beantworten.
Irgendwann kommt dann die Meldung, dass ein Linux-System vorgefunden wurde und es wird angeboten, dieses zu booten. Bitte diese Option auswählen. So kommt man zumindest an das Linux-System ran und kann von dort aus den Bootloader wiederherstellen.
Wichtig: Allein dadurch wird das Windows-System nicht wieder bootbar! Das geht nur nach der Anleitung gemäß dem Link, den ich oben gepostet habe.
Viel Erfolg, ich hoffe, dass Du beide Systeme wieder hinkriegst, möglich ist es auf jeden Fall...